Teaching 2019-2020CHIM-F-324: Travail de fin de cycleTitulaires : Yannick DE DECKER, Jean-Christophe LELOUP Public cible : Bachelier en sciences chimiques - Poursuite du cursus (10 crédits, obligatoire). Objectifs : Se former à l’argumentation et à la démarche scientifique, se former à la méthodologie documentaire,
se former à la communication orale et écrite, développer son esprit critique, développer son esprit de synthèse. Contenu : Réalisation d'un projet de communication scientifique en équipe et d'un travail individuel
de recherche bibliographique sur une thématique sélectionnée. CHIM-F-4001: Rationale drug design and PKPD modelingTitulaires : Jean-Christophe LELOUP, Martine PREVOST Public cible : Master en bioinformatique et modélisation à finalité approfondie ,
Master en sciences chimiques, Master bioingénieur en chimie et bio-industries, à finalité spécialisée,
Master en ingénieur civil biomédical. (5 crédits, optionnel) Objectifs : Introducing different aspects of rational drug design and of the pharmacodynamic
and pharmacokinetic properties of drugs. Contenu : In the first part "Rational Drug Design", introducing the computer-assisted and experimental
methods used in rational drug designand detailing both the ligand-based and structure-based approaches.
In the second part "PK/PD modelling", introducing the students to the concept of mathematical modelling
in pharmacokinetics and pharmacodynamics to describe and predict the time course of drug effects under various conditions. CHIM-F-422: Modélisation des rythmes du vivantTitulaires : Geneviève DUPONT, Didier GONZE, Jean-Christophe LELOUP Public cible : Master en bioinformatique et modélisation, à finalité approfondie (5 crédits, obligatoire),
Master en sciences chimiques (5 crédits, optionnel), Master bioingénieur en chimie et bio-industries, à finalité
spécialisée (5 crédits, optionnel). Objectifs : La modélisation est un outil de plus en plus utilisé pour comprendre, décrire et prédire
le comportement de systèmes biologiques complexes. Le but de ce cours est de présenter différentes
méthodes d'analyse et de simulation de la dynamique des réseaux de régulation et des voies de
transduction de signaux en se basant sur des exemples biologiques concrets. Contenu : Les thèmes précisément abordés concernent, par exemple, les rythmes circadiens (24h),
les oscillations et les ondes de calcium, la propagation de l'influx nerveux, le cycle cellulaire, etc.
Le programme précis dépend des étudiants inscrits et des possibles intervenants. MémoiresThématiques actuelles : L'horloge circadienne, caractérisée par une période de 24h, est essentielle à l'adaptation des organismes à
leur environnement qui varie de manière périodique. Les rythmes circadiens, générés au niveau moléculaire
par un réseau complexe de régulations génétiques, constituent un système de choix pour la modélisation computationnelle.
Les rythmes circadiens se retrouvent chez de nombreux organismes (mammifères, plantes, insectes, bactéries, ...) et régulent
de nombreuses fonctions biologiques. Chez l'homme, de nombreux désordres physiologiques (troubles du sommeil, dépressions,
obésité, …) ont été récemment liés à des dysfonctionnements de l'horloge circadienne. Des modèles théoriques permettent
de clarifier les liens entre perturbations génétiques et troubles physiologiques, mais aussi de tester l'effet sur
l'horloge circadienne de perturbations de l'environnement (décalages horaires simples ou chroniques, pollution lumineuse, …).
Dans le cadre d'un mémoire, nous proposons au sein de l'Unité de Chronobiologie Théorique d'approfondir l'un de ces thèmes. Anciens sujets de mémoire : Etude théorique de l'effet du lithium sur l'horloge circadienne chez l'homme,
Modélisation du lien entre rythmes circadiens et apoptose, Contrôle de la période et de la phase des oscillations dans
un modèle pour les rythmes circadiens chez les mammifères, Modélisation du cycle cellulaire et de son couplage avec
les rythmes circadiens chez les mammifères, Modélisation du mécanisme d'action des phosphatases dans l'horloge
circadienne de la drosophile et des mammifères.
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